Barry Cooper (* 1949 in Westcliff-on-Sea, Essex) ist ein englischer Musikwissenschaftler.
Cooper studierte Musikwissenschaften und Orgel in Oxford, erhielt den Master 1973 und promovierte 1974. Nach einem Lehrauftrag an der Universität St Andrews ging er zur Universität Aberdeen. Seit 1990 ist er Professor an der Universität Manchester.
Sein Forschungsinteresse gilt der englischen Barock-Musik und Ludwig van Beethoven. Er ist Herausgeber und Autor des Beethoven Compendium (1991). Dieses Standardwerk der Beethovenforschung ist inzwischen ins Französische, Deutsche und Japanische übersetzt worden.
Aufsehen erregte die Uraufführung seiner Rekonstruktion des ersten Satzes der 10. Sinfonie von Beethoven in der Royal Festival Hall in London 1988 mit dem Royal Liverpool Philharmonic Orchestra unter der Leitung von Walter Weller. Auch das London Symphony Orchestra unter der Leitung von Wyn Morris hat inzwischen das Beethoven-Fragment eingespielt.
Darüber hinaus hat er den verloren geglaubten langsamen Satz von Beethovens Streichquartett G-Dur op. 18 Nr. 2 rekonstruiert, den das Quatuor Danel im September 2011 in Manchester zur Uraufführung brachte.