Simone Molinaro (ca. 1570 - Mai 1636) war ein Komponist der Spätrenaissance in Italien. Er war vor allem für seine Lautenmusik bekannt.
Molinaro wurde in Genua geboren. Er studierte Musik bei seinem Onkel, Giovanni Battista Dalla Gostena, der Maestro di cappella am Dom von Genua war. Im Jahr 1593 wurde Gostena ermordet, und Molinaro trat 1599 seine Nachfolge am Dom an. Im selben Jahr veröffentlichte er die Intavolatura di liuto, die Lautenwerke sowohl von ihm selbst als auch von Gostena enthielt. Neben seinen Lautenwerken komponierte Molinaro eine große Anzahl geistlicher Chormusik, von der der größte Teil aufgrund fehlender Stimmbücher nicht vollständig erhalten ist. Einige fünfstimmige Motetten sind jedoch in den Sammlungen von Hasler und Schadaeus erhalten geblieben. Molinaro starb im Mai 1636 in Genua.
Molinaro fungierte auch als Herausgeber der Werke von Carlo Gesualdo und gab 1585 und 1613 Ausgaben der Madrigale dieses Komponisten heraus.